Swissuniversities (https://www.swissuniversities.ch)

Zuzana Musilová (Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.)

139 128,30 CHF

University of Basel
Department of Environmental Sciences

Hejna ryb druhu cichlida na Velkých jezerech ve Východní Africe jsou hlavním modelovým systémem v evoluční biologii. Jezera Tanganyika, Malawi a Victoria oplývají jedinečnou skupinou stovek endemických druhů ryb cichlida, které se každý rok vyvíjely od několika miliónů pouze k několika tisícům. Faktory stojící za explozivním vznikem druhů ryb cichlida však zůstávají nejasné. V nedávné době byly ryby cichlidy určeny jako modelový systém v evoluční genetice a genomice a pět druhů ryb cichlida je v současné době sekvenováno v Broad Institute of MIT and Harvard. To poskytuje zcela novou možnost studovat genetický a genomický základ evolučního úspěchu ryby cichlida. V tomto projektu plánujeme využít tyto nové možnosti použitím nadcházejících genomů ryby cichlida a aplikováním technologie sekvenování příští generace k získání dvanácti nových transkriptomů ryby cichlida. Hodláme hledat speciální genomické rysy u ryby cichlida a testovat význam genové duplikace a změnu v počtu kopií („copy number variation“, CNV) ve vývoji ryby cichlida. S evoluční a komparativní genomickou analýzou nového genomu a transkriptomu údajů očekáváme vzrušující nové náhledy do genetické a genomické báze diverzifikace organismů všeobecně a do evoluce ryby cichlida zvláště. SalzburgerLab v Bazileji má odborné znalosti pro tyto druhy analýz a přístup k sekvenování příští generace a komparativní genomické analýze. To tedy poskytne ideální školicí prostředí pro žadatele, Zuzanu Musilovou.